Действие игры Shadow of the Ninja разворачивается в древней Японии. Это сайд-скроллинговый платформер-головоломка с богатой графикой и анимацией. Игроки возьмут на себя роль Аканэ, ученицы ниндзя, которая использует несмертельные скрытные способности, такие как маскировка и телепортация, чтобы отвоевать свою мирную деревню у злого клана самураев.